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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
Data corrente: |
18/11/2013 |
Data da última atualização: |
21/09/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CASTRO, A. P. de; SILVA, M. R. S. S. da; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. |
Afiliação: |
Alinne Pereira de Castro, UnB; Maria Regina Silveira Sartori da Silva, UnB; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; Ricardo Henrique Krüger, UnB. |
Título: |
Combining "Omics" strategies to analyze the biotechnological potential of complex microbial environments. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Current Protein and Peptide Science, v. 14, n. 6, 2013. |
DOI: |
10.2174/13892037113149990062 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
It is well established in the scientific literature that only a small fraction of microorganisms can be cultured by conventional microbiology methods. The ever cheaper and faster DNA sequencing methods, together with advances in bioinformatics, have improved our understanding of the structure and functional behavior of microbial communities in many complex environments. However, the metagenomics approach alone cannot elucidate the functionality of all micro-organisms, because a vast number of potentially new genes have no homologs in public databases. Metatranscriptomics and metaproteomics are approaches based on different techniques and have recently emerged as promising techniques to describe microbial activities within a given environment at the molecular level. In this review, we will discuss current developments and applications of metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics, and their limitations in the study of microbial communities. The combined analysis of genes, mRNA and protein in complex microbial environments will be key to identify novel biological molecules for biotechnological purposes. |
Palavras-Chave: |
Metagenome; Metaproteome; Metatranscriptome and microbial diversity. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01801naa a2200205 a 4500 001 1971297 005 2017-09-21 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.2174/13892037113149990062$2DOI 100 1 $aCASTRO, A. P. de 245 $aCombining "Omics" strategies to analyze the biotechnological potential of complex microbial environments.$h[electronic resource] 260 $c2013 520 $aIt is well established in the scientific literature that only a small fraction of microorganisms can be cultured by conventional microbiology methods. The ever cheaper and faster DNA sequencing methods, together with advances in bioinformatics, have improved our understanding of the structure and functional behavior of microbial communities in many complex environments. However, the metagenomics approach alone cannot elucidate the functionality of all micro-organisms, because a vast number of potentially new genes have no homologs in public databases. Metatranscriptomics and metaproteomics are approaches based on different techniques and have recently emerged as promising techniques to describe microbial activities within a given environment at the molecular level. In this review, we will discuss current developments and applications of metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics, and their limitations in the study of microbial communities. The combined analysis of genes, mRNA and protein in complex microbial environments will be key to identify novel biological molecules for biotechnological purposes. 653 $aMetagenome 653 $aMetaproteome 653 $aMetatranscriptome and microbial diversity 700 1 $aSILVA, M. R. S. S. da 700 1 $aQUIRINO, B. F. 700 1 $aKRUGER, R. H. 773 $tCurrent Protein and Peptide Science$gv. 14, n. 6, 2013.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registros recuperados : 64 | |
5. | | TAVARES, P.; SILVA, M. R. S. S.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F. Accessing lipases from soil metagenoma and their application for microbial biofuel production. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu, PR. Anais... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011. Não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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6. | | TAVARES, P.; BERGMANN, J.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E.; QUIRINO, B. F. Accessing lipases from soil metagenome as an aid for biofuel production. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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7. | | BALESTRINI, V. P.; PINTO, O. H. B.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise de genomas montados a partir de uma comunidade microbiana enriquecida com lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 10.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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10. | | CASTRO, V. H. L.; MAGALHÃES, B. S.; QUIRINO, B. F.; KRÜGER, R. H.; BARRETO, C. C. Enriquecimento de bactérias "ainda não cultivadas" apresentando atividade de xilanase. In: WORKSHOP EM CIÊNCIAS GENÔMICAS E BIOTECNOLOGIA, 1., 2009, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: [UCB], 2009. Não paginado.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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11. | | QUIRINO, B. F.; BARRETO, C. C.; PAPPAS, G. J.; ZEGLE, K.; KRAMPIS, K.; KRUGER, R. H. Genomes and post-genome technology. In: FALKOW, S.; ROSENBERG, E.; SCHLEIFER, K-H.; STACKEBRANDT, E.; DWORKIN, M. (Ed.). The prokaryotes. Berlin: Springer-Verlag, 2013.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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15. | | CASTRO, A. P.; PAPPAS, G.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. In silico analysis to compare the 18S rRNA gene libraries and estimate species richeness whitin Biome Cerrado. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts: program and abstracts. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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17. | | MENDES, I. V.; GARCIA, M. B.; SANTANA, R. H.; GLADDEN, J.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise funcional e da diversidade de um consórcio microbiano capaz de degradar lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 36.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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18. | | CUNHA, I. S.; BOMFIM, M. A. D.; MOLINARI, H. B. C.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construção de biblioteca metagenômica de pequenos insertos com DNA de rúmen de caprinos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 565.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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19. | | CUNHA, I. S.; LEMOS, T. O.; BOMFIM, M. A. D.; MOLINATI, H.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construção de biblioteca metagenômica de pequenos insertos com DNA de rúmen de caprinos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 565. Resumo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Registros recuperados : 64 | |
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