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Biblioteca(s):  Embrapa Agroenergia.
Data corrente:  18/11/2013
Data da última atualização:  21/09/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  CASTRO, A. P. de; SILVA, M. R. S. S. da; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H.
Afiliação:  Alinne Pereira de Castro, UnB; Maria Regina Silveira Sartori da Silva, UnB; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; Ricardo Henrique Krüger, UnB.
Título:  Combining "Omics" strategies to analyze the biotechnological potential of complex microbial environments.
Ano de publicação:  2013
Fonte/Imprenta:  Current Protein and Peptide Science, v. 14, n. 6, 2013.
DOI:  10.2174/13892037113149990062
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  It is well established in the scientific literature that only a small fraction of microorganisms can be cultured by conventional microbiology methods. The ever cheaper and faster DNA sequencing methods, together with advances in bioinformatics, have improved our understanding of the structure and functional behavior of microbial communities in many complex environments. However, the metagenomics approach alone cannot elucidate the functionality of all micro-organisms, because a vast number of potentially new genes have no homologs in public databases. Metatranscriptomics and metaproteomics are approaches based on different techniques and have recently emerged as promising techniques to describe microbial activities within a given environment at the molecular level. In this review, we will discuss current developments and applications of metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics, and their limitations in the study of microbial communities. The combined analysis of genes, mRNA and protein in complex microbial environments will be key to identify novel biological molecules for biotechnological purposes.
Palavras-Chave:  Metagenome; Metaproteome; Metatranscriptome and microbial diversity.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agroenergia (CNPAE)
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CNPAE2301 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoPEIXOTO, J.; SILVA, L. P.; KRÜGER, R. H. Brazilian Cerrado soil reveals an untapped microbial potential forunpretreated polyethylene biodegradation. Journal of Hazardous Materials, v. 324, p. 634-644, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCUNHA, I. S.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construção de uma biblioteca metagenômica de expressão da microbiota de rúmen de caprinos. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2009. 6 p. (Embrapa Agroenergia. Comunicado técnico, 002).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoKRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F.; CORDEIRO, D. M. Engenharia de transgênicos: metodologia. In: QUIRINO, B.F. Revolução dos Transgênicos. Rio de Janeiro: Interciência, 2008.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCARVALHO, L. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Triagem de Bibliotecas Metagenômicas para Isolamento de Clones com Atividade de Celobiohidrolase. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2012, Santos, SP. [Anais...]. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia: Asociación Latinoamericana de Microbiologia, 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoTAVARES, P.; SILVA, M. R. S. S.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F. Accessing lipases from soil metagenoma and their application for microbial biofuel production. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu, PR. Anais... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoTAVARES, P.; BERGMANN, J.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E.; QUIRINO, B. F. Accessing lipases from soil metagenome as an aid for biofuel production. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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7.Imagem marcado/desmarcadoBALESTRINI, V. P.; PINTO, O. H. B.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise de genomas montados a partir de uma comunidade microbiana enriquecida com lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 10.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoQUIRINO, B. F.; CANDICO, E. S.; CAMPOS, P. F.; FRANCO, O. L.; KRUGER, R. H. Proteomic approaches to study plant-pathogen interactions. Phytochemistry, v. 71, p. 351-362, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, D. F. K. dos; ISTVAN, P.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F.; KRÜGER, R. H. New dioxygenase from metagenomic library from Brazilian soil: insights into antibiotic resistance and bioremediation. Biotechnology Letters, v. 37, n. 9, p.1809-1817, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, V. H. L.; MAGALHÃES, B. S.; QUIRINO, B. F.; KRÜGER, R. H.; BARRETO, C. C. Enriquecimento de bactérias "ainda não cultivadas" apresentando atividade de xilanase. In: WORKSHOP EM CIÊNCIAS GENÔMICAS E BIOTECNOLOGIA, 1., 2009, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: [UCB], 2009. Não paginado.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoQUIRINO, B. F.; BARRETO, C. C.; PAPPAS, G. J.; ZEGLE, K.; KRAMPIS, K.; KRUGER, R. H. Genomes and post-genome technology. In: FALKOW, S.; ROSENBERG, E.; SCHLEIFER, K-H.; STACKEBRANDT, E.; DWORKIN, M. (Ed.). The prokaryotes. Berlin: Springer-Verlag, 2013.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, D. F. K.; ISTVAN, P.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Functional metagenomics as a tool for idenfication of new antibiotic resistance genes from natural environments. Microbial Ecology, October 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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13.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, D. F. K. dos; ISTVAN, p.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Functional metagenomics as a tool for identification of new antibiotic resistance genes from natural environments. Microbial Ecology, v. 73, n. 2, p. 479-491, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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14.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. P. de; SILVA, M. R. S. S. da; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Combining "Omics" strategies to analyze the biotechnological potential of complex microbial environments. Current Protein and Peptide Science, v. 14, n. 6, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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15.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. P.; PAPPAS, G.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. In silico analysis to compare the 18S rRNA gene libraries and estimate species richeness whitin Biome Cerrado. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts: program and abstracts. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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16.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, V. H. L. de; SCHROEDER, L. F.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H.; BARRETO, C. C. Acidobacteria from oligotrophic soil from the Cerrado can grow in a wide range of carbon source concentrations. Canadian Journal of Microbiology, v. 59, p. 1-8, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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17.Imagem marcado/desmarcadoMENDES, I. V.; GARCIA, M. B.; SANTANA, R. H.; GLADDEN, J.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise funcional e da diversidade de um consórcio microbiano capaz de degradar lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 36.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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18.Imagem marcado/desmarcadoCUNHA, I. S.; BOMFIM, M. A. D.; MOLINARI, H. B. C.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construção de biblioteca metagenômica de pequenos insertos com DNA de rúmen de caprinos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 565.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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19.Imagem marcado/desmarcadoCUNHA, I. S.; LEMOS, T. O.; BOMFIM, M. A. D.; MOLINATI, H.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construção de biblioteca metagenômica de pequenos insertos com DNA de rúmen de caprinos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 565. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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20.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. P. de; QUIRINO, B. F.; ALLEN, H.; WILLIAMSON, L. L.; HANDELSMAN, J.; KRÜGER, R. H. Construction and validation of two metagenomic DNA libraries from Cerrado soil with high clay content. Biotechnology Letters, v. 33, 2011. Published online. DOI 10.1007/s10529-011-0693-6.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
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